הסוגר הפיזיולוגי מתייחס לטבעת או שסתום שרירי השולטים בפתיחה ובסגירה של צינור או מעבר בגוף, כגון פי הטבעת, הוושט או שלפוחית השתן. סוג זה של סוגר נשלט באופן לא רצוני על ידי מערכת העצבים האוטונומית והוא חיוני לוויסות זרימת הנוזלים וחומרים אחרים בגוף. המונח "פיזיולוגי" משמש כדי להבדיל סוג זה של סוגר סוגר "פתולוגי", שעלול להיגרם על ידי מחלה או פציעה.