Ang terminong "homeobox gene" ay tumutukoy sa isang klase ng mga gene na nagko-code para sa mga protina na kilala bilang mga homeodomain na protina. Ang mga protina na ito ay naglalaman ng isang partikular na domain na nagbubuklod ng DNA na tinatawag na homeodomain, na nagbibigay-daan sa kanila na magbigkis sa mga partikular na pagkakasunud-sunod ng DNA at i-regulate ang pagpapahayag ng iba pang mga gene. Ang mga homeobox gene ay gumaganap ng mga kritikal na tungkulin sa pag-unlad ng embryonic at kasangkot sa regulasyon ng pagkita ng kaibahan ng cell at pagbuo ng tissue. Matatagpuan ang mga ito sa malawak na hanay ng mga organismo, kabilang ang mga hayop, halaman, at fungi.