Struktuurgenomika verwys na die studieveld wat fokus op die bepaling en ontleding van die driedimensionele strukture van proteïene op 'n genoomwye skaal. Dit behels die toepassing van verskeie eksperimentele en berekeningstegnieke om die atoomkoördinate en ruimtelike rangskikking van proteïenmolekules te bepaal. Die primêre doel van strukturele genomika is om die verband tussen proteïenstruktuur en funksie te verstaan, asook om die ontdekking van nuwe proteïenteikens vir geneesmiddelontwikkeling en ander toepassings te fasiliteer. Deur sistematies die strukture van proteïene te bepaal, beoog strukturele genomika om waardevolle insigte te verskaf in die organisasie, interaksie en funksie van biologiese makromolekules op 'n molekulêre vlak.