Fisiologiese anatomie verwys na die studie van die struktuur en organisasie van lewende organismes, veral mense en diere, met die klem op die funksionering en meganismes van hul fisiologiese sisteme. Dit behels die studie van hoe verskillende organe, weefsels en selle saamwerk om die behoorlike funksionering van die liggaam te handhaaf, en hoe hulle reageer op interne en eksterne stimuli. Die dissipline van fisiologiese anatomie kombineer beginsels van anatomie, fisiologie en biochemie om die komplekse interaksies tussen verskillende dele van die liggaam en die prosesse wat hulle beheer, beter te verstaan.