'n Harpoengeweer is 'n gespesialiseerde vuurwapen of pneumatiese gereedskap wat ontwerp is om 'n harpoen, 'n soort spies, op groot waterdiere soos walvisse, haaie of robbe te skiet vir jag- of wetenskaplike navorsingsdoeleindes. Die harpoengeweer word tipies gelaai met 'n harpoen, wat aan 'n lyn of tou vasgemaak is, en wanneer dit afgevuur word, dring die harpoen die dier se liggaam binne en maak dit aan die boot of aan 'n boei vas. Harpoengewere word dikwels in kommersiële walvis- of visvangbedrywe gebruik, sowel as in sekere soorte mariene navorsing.