Die woordeboekbetekenis van die woord "antiprotosoale middel" is 'n medikasie wat gebruik word om infeksies wat deur protosoë-parasiete veroorsaak word, te behandel. Protosoë is eensellige organismes wat 'n verskeidenheid siektes kan veroorsaak, soos malaria, giardiasis en trichomoniase. Antiprotosoale middels werk deur die protosoë te teiken en hulle óf dood te maak óf hul groei en voortplanting te stop. Enkele algemene voorbeelde van antiprotosoale middels sluit chlorokien, metronidasool en kinien in.