Die term "antiprotosoë" verwys na enige stof of behandeling wat gebruik word om infeksies wat deur protosoë veroorsaak word, te voorkom of te behandel. Protosoë is 'n diverse groep eensellige organismes wat verskeie siektes by mense en diere kan veroorsaak, soos malaria, giardiasis en toksoplasmose.Daarom is 'n antiprotosoale middel of middel enige medikasie of verbinding wat ontwerp is om protosoë te teiken en hul groei te inhibeer of dood te maak, of sodoende die gepaardgaande infeksie te help voorkom. Voorbeelde van antiprotozoale middels sluit in chlorokien vir malaria, metronidasool vir giardiasis en trichomoniase, en atovakoon vir toksoplasmose.